GAMIT10.5安装及更新失败解决办法

2016-02-13 6:31:55 暂无评论雪泥 linux系统 769

1、针对目前比较流行的两种linux发行版，先附上Gamit10.5安装时的准备工作，默认你已获得root权限或为root用户。

Fedora21	Ubuntu14.04
yum install tcsh yum install gcc yum install gcc-gfortran yum install libX11*(bash下安装)	apt-get install csh apt-get install tcsh apt-get install gfortran(gcc自带) apt-get install libx11-dev

2、更改shell为tcsh，命令为 chsh，改好后重启系统，并用命令 echo $SHELL 查询当前shell。
root@linuxidc:/home/ajie# chsh
Changing the login shell for root
Enter the new value, or press ENTER for the default
Login Shell [/bin/bash]: /bin/tcsh
############# 重启 #############
linuxidc:/home/ajie# echo $SHELL
/bin/tcsh
以上为修改过程，最后显示 /bin/tcsh，即修改成功！Fedora可能会出现警告：chsh: Warning: “/bin/tcsh” is not listed in /etc/shells. 原因是/bin/tcsh不在/etc/shells文件里，普通用户会调用失败，root调用出现警告。
[root@linuxidc ~]# cat /etc/shells
/bin/sh
/bin/bash
/sbin/nologin
/usr/bin/sh
/usr/bin/bash
/usr/sbin/nologin
/usr/bin/tcsh —–>以/usr/bin/tcsh代替/bin/tcsh
/usr/bin/csh
3、修改配置文件Makefile.config，此为Gamit成功安装与否的关键！
①Gamit的更新包中更新了配置文件，名为Makefile.config.new，增加了f90.a的编译规则，此外增大了linux发行版（Fedora和Ubuntu）的OS_ID范围，建议直接以Makefile.config.new替换原Makefile.config进行安装；
②自行修改MAXSAT，MAXATM，MAXEPC等参数，注意不要改的太大，否则可能造成某些模块（如solve）编译失败；
③关于X11的路径，Fedora不用修改，Gamit安装程序可自动搜索获得正确路径；Ubuntu须手动配置，通过find命令找到libX11*和Xlib.h的路径（X须为大写），并替换Makefile.config中的相应内容，重新安装；
linuxidc:/usr/include/X11# find / -name “libX11*”
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libX11.so.6
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libX11.a
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libX11.so
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libX11.so.6.3.0
……
linuxidc:/usr/include/X11# find / -name “Xlib.h”
/usr/include/X11/Xlib.h
④对于x64系统，Linux块下的c.a的编译规则，改不改皆可成功安装，个人建议修改，改后的效果为
#CFLAGS = -g （加注释符）
#### For 64-bit machines:
CFLAGS = -g -m64 -DADD64BIT （删除注释符）
对于32位系统，要改两个地方：a.修改Linux块下的FFLAGS的参数-m64为-m32；b.修改/opt/gamit/gamit/solve/Makefile.generic文件中的-m64为-m32（x86系统未做测试，仅供参考）。